多位点序列分型(MLST)

BioNumerics 为多位点序列分型（MLST）提供了一个全自动的分析流程。通过 MLST 插件，BioNumerics 软件被广泛用于 MLST 序列的存储和分析。

BioNumerics 自动分析批量序列跟踪文件，连接 pubMLST 数据库，检索相应的等位基因编号、序列型以及可用克隆复合体 clonal complex 信息。

处理好序列后，BioNumerics 可以在几秒钟内鉴定数百个菌株。结果存储在数据库中，其结果可进一步进行统计和群体分析、聚类、分区和鉴定等。

全自动分析流程：

自动导入且能够批量拼接不同来源的测序峰图文件（AB, Beckman, Amersham, FASTA）；直接利用序列文件名称解析菌株编号及基因等信息。

批量拼接完成后自动生成报告，列出每个菌株或基因的拼接状态。

双击对应拼接问题便显示详细信息窗口。

双击特定问题窗口即可打开Assembler窗口，并选中对应碱基位置。

可实时比对 MLST 数据库进行等位基因和 MLST 型别鉴定，或者与本地数据库进行比较。

选中菌株的等位基因和MLST型别信息可随时进行更新。

计算和显示克隆群分群信息及使用进一步的统计分析工具。