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中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络 - PulseNet China 简介
背景

   2003年SARS危机给国民经济造成了严重损失。在这场危机之后,国家建立了突发公共卫生事件应急机制,强化了疾病预防控制体系,进一步完善了公共卫生信息体系。中国疾控中心于2004年1月1日启动了中国传染病监测信息系统,该系统极大的提高了监测和处理传染病疫情和公共卫生突发事件的能力和速度。

  当前,国际贸易和旅游以及人流物流的迅猛发展,传染病跨越地区传播已成为传染病预防控制面临的重要问题。一些分布在不同地区的呈散在分布的暴发流行,单从监测数据上很难发现,对于这类散点暴发传染病的监测,必须通过细致的病原体监测分析以及流行病学调查才能揭示其内在联系。传染病暴发呈现的新特点对疾病监测信息报告管理和突发公共卫生事件应对提出新的挑战。

  细菌性传染病仍然是传染病疾病暴发流行的重要原因。基于当前细菌性传染病的传播特征以及公共卫生威胁,由美国疾病预防控制中心首先发起,建立了实验室分子分型监测网络-PulseNet。美国PulseNet网络依托各地州监测实验室,通过分离的病原细菌DNA“指纹图谱”分析(主要利用脉冲场凝胶电泳技术等)以及网络化信息交流平台,发现传染病的跨地区和国际间传播,开展传染病暴发流行的调查、追踪、溯源,已经成功发现处置和预警了多起食源性传染病暴发疫情。

  目前国际PulseNet已经拓展到众多区域,组成了包括加拿大PulseNet、欧洲PulseNet、亚太区PulseNet、拉丁美洲PulseNet、中亚PulseNet在内的国际化网络。该网络也已经成为世界卫生组织以及国际公共卫生机构获取信息和应对公共卫生事件的重要依据。国际PulseNet涉及的传染病病原体包括产毒性大肠杆菌O157、沙门菌、单增李斯特菌、志贺菌、弯曲杆菌、霍乱弧菌等。

  2004年9月,由中国疾病预防控制中心(CDC)传染病预防控制所组织,在北京召开了我国细菌性传染病实验室分子分型监测网络(PulseNet China)成立会议,我国PulseNet China工作正式启动。PulseNet China作为国际和亚太区网络成员,旨在建立我国细菌分子分型监测的网络体系。PulseNet China成立后,在公共卫生行业专项和传染病防治重大专项等的支持下,致力于我国细菌实验室监测技术研究和推广以及实验室网络组织管理及网络信息系统建设,目前在多个省市级疾控中心(CDC)实验室建立了PFGE分型技术。

  PulseNet网络体系是未来我国实验室病原体监测应用于传染病预防控制的发展方向,是我国传染病预防控制技术支撑体系的重要组成部分。伴随着PulseNet的发展,PulseNet的内涵也与时俱进,它不仅仅是指PFGE技术,而是细菌分子分型监测网络化理念的实践和创新,是实验室监测体系的重要组成部分;在开展分型监测的疾病上不仅包括食源性传染病,还包括人兽共患传染病等;分型方法上除了包括PFGE方法,还包括重复序列扩增多态性(MLVA)和多基因座序列测定(MLST)、单核苷酸多态性分析(SNP)等。

PulseNet China网络的功能

   PulseNet China是基于对我国细菌性传染病病原体的分型分析和信息交流的实验室监测网络体系。PulseNet China实验室网络包括中国疾控中心传染病所中心实验室和分布于各省/市的监测网络参与实验室以及其他传染病防治机构的细菌分子分型监测实验室(后两者简称网络实验室)。PulseNet China实验室采用标准化的细菌实验室分子分型技术,依托细菌分型中心数据库和查询平台以及信息系统平台,通过分布于各地的网络实验室的即时检测、分型比对、报告反馈,发现特征型别的簇,提出预警信息,进而结合流行病学调查发现暴发关联,尤其是发现散在分布于不同地理区域的暴发关联,查找危险因素,明确传播途径,追溯传染来源。

  PulseNet China同时也是亚太区病原菌实验室监测网络(PulseNet Asia Pacific)和国际网络(PulseNet International)的重要组成部分,与这些网络相联系,通过对全球范围监测信息的查询和比对,进而掌握相关传染病病原菌的流行情况和病原特征。

PulseNet China网络的特点

   PulseNet China旨在建立我国细菌分子分型监测的网络体系,是基于细菌性传染病病原体分型分析和信息交流的实验室监测网络体系。PulseNet China网络着力监测发现病原菌分子分型特征型别簇,进而发现和应对细菌性传染病的暴发流行;PulseNet China网络着力于解决传染病的跨地区传播问题,尤其是发现分布在不同地区的呈散在分布却有着共同传染来源的暴发流行。

   PulseNet China利用标准化实验室分子分型技术,依托国家CDC中心实验室细菌分子分型中心数据库和查询平台,通过分布于各地的网络实验室收集致病菌,即时开展分型分析以及遗传特征比对,通过及时报告反馈,发现特征型别的暴发簇,提出预警信息,结合流行病调查,发现散在分布于不同地理区域的暴发线索,识别传染病散发病例间的关联,进而查找危险因素,明确传播途径,追溯暴发来源。PulseNet China同国际网络(PulseNet International)相联系,通过对全球范围细菌分型监测信息的查询和比对,掌握涉及我国利益的相关病原菌传染病的流行情况和病原特征。PulseNet China网络服务于我国细菌性传染病暴发的早期预警分析、突发公共卫生事件的应对、暴发流行的溯源、新发传染病的发现。

  病原菌分子分型监测是未来我国细菌性传染病实验室监测的发展方向,是我国传染病预防控制的关键支撑技术,也是我国公共卫生应急体系的重要组成部分。PulseNet China监测网络是我国传染病监测理念的创新,是我国传染病防控单位在监测领域的更深层次合作和进步,它的技术起点更高、监测更精确、内容更丰富、指向性更强。

PulseNet China已开展的工作

   2004年9月成立PulseNet China后,PulseNet China致力于标准化病原菌分子分型技术在全国CDC系统的推广和分子分型数据库建设。截止2009年,中国CDC传染病预防控制所将PFGE技术推广至全国30余个省级或市级CDC,有超过60余名实验室专业人员接受了培训;多数食源性病原菌已建立标准化的PFGE方法;已经建立聚类分析和查询比对平台;在数据库建设方面,已经建立20余个病种,25000余条菌株的分型数据库,这些菌株数据涵盖我国不同地区、不同年代分离菌株的流行病学和病原学资料、基因分型数据资料。截止2009年,中心信息数据库涵盖的细菌病原体包括霍乱弧菌、大肠杆菌O157:H7、伤寒副伤寒沙门菌、痢疾志贺菌、小肠结肠炎耶尔森菌、单核细胞增多性李斯特菌、空肠弯曲菌、副溶血弧菌等食源性病原菌,以及鼠疫杆菌、流行性脑脊髓膜炎双球菌、莱姆病疏螺旋体、钩端螺旋体、布鲁氏菌等。上述分析平台和数据资料在我国2004年C群流脑暴发处置、2005年猪链球菌感染暴发处置、多起霍乱弧菌暴发与应急处置、我国小肠结肠炎耶尔森菌和沙门氏菌流行特征分析等工作中得到了很好的应用。

PulseNet China今后的工作重点

   进一步拓展实验室网络,强化省级疾病预防控制中心区域中心实验室的分型监测能力,继续拓展有条件的省会城市和地级市CDC等疾控中心加入病原菌分型实验室监测网络。建立覆盖全国的省、市和重点县(区)以及更多传染病相关防治单位(如检验检疫、食品、农业、铁路、民航CDC传染病相关防治单位等)参加的全国细菌性传染病分子分型实验室监测网络。

   进一步拓展监测的病原体种类,扩大菌株量信息,对新发病原和人兽共患病病原开展分型监测。开展新技术和标准技术的推广应用,推广应用二代PulseNet China分子分型技术, 如MLVA、SNP等。推广更易于操作、重复性更强、不同实验室可参比、更易于网络化应用的分型方法。

   建立申请-认可制度,完善网络实验室质量保障和质量控制。建立PulseNet China网络成员单位分型监测的高效运行机制,实现细菌性传染病的即时分型、即时报告、即时预警、即时暴发调查、即时卫生处理。

   开展分型监测地理信息系统分析,建立分型结果的地理标注,趋势评价、生态分析等。实现分型结果的精密定位和即时展示分析等。

   推广和应用“疾控系统病原菌分子分型数据分析与发布的网络信息化系统”工作软件,完善网络实验室数据交换系统的建设,实现分型数据即时交互式查询、比对和报告。建立基于序列和特征数据信息的数据库和查询系统。

   开展人员培训和能力建设,包括硬件和软件建设,完善组织管理和技术文件。中心实验室和有条件的网络实验室申报国家实验室认证认可等。
(转载自:PulseNet China)
 
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