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BioNumerics版本更新升级信息
 
 
2014年12月BioNumerics发布7.5版本 (www.shanghaiep.com)

  2014年12月,Applied Maths公司隆重推出了BioNumerics7.5版本。BioNumerics7.5主要的新功能包括重新设计的MLVA插件,提供云计算的功能,以及全新的全基因组MLST插件;进一步增强了软件本身的性能和存储量,以及更便捷的输出功能。此外,软件现在提供了分析特征类型实验子文件、指纹和光谱实验类型、在比较窗口链接条目功能。BoiNumerics7.5相比7.1版本功能主要改进如下:

  1. 软件在64bit Windows上无缝运行,速度和性能得到巨大的改善。
  2. 新植入的基于SQLite数据库引擎文件,使得数据库容量最高可达32TB。
  3. 用更专业的数据库,从MS Access方便数据迁移连接新数据库,避免了访问2GB存储限制的问题。
  4. 新的预览选项能够快速导入模板和解析数据。
  5. 最近使用过的导入程序方便地组合在一起,便于访问。
  6. 大大增强了对图形内容导出的选项,直接输出TIFF,PNG,PDF,SVG等格式文件成为可能。
  7. BioNumerics数据库之间更方便、更灵活的数据交换。
  8. 进程向导新增一键式工具,能够对所选项目快速启动通用或常规的操作。
  9. “不要再显示此消息”的选项避免了多余信息的确认显示。
  10. 根据用户的反馈,新增选择条目置顶的功能(键盘快捷键Ctrl+T)。

  如果您想要了解更详细的产品信息,欢迎您与BioNumerics软件中国区代理商联系,上海一贝科技有限公司将给您提供技术解答和产品服务。

2013年06月04日BioNumerics发布7.1版本 (www.shanghaiep.com)

* 最新的、高度灵活的数据库设计可以更好地运用层级(level)及依赖性(dependencies):在重复、复制和菌株多重取样上有提高。
* 一个强大的类似Google的搜索窗口可以让你迅速的找到录入、实验类型等。
* 在新数据类型的扩展功能上重新设计的导入窗口,一个简单易用的向导来帮助你导入不同类型的数据或数据源,可以更好的控制更新录入或向数据库加入新的录入。
* 改进了直接从微软Excel文件导入数据的功能。
* 数据库容量达到10GB,使用默认的微软SQL Express 数据库引擎。
* 在一个页面中无限量的数据库录入。
* 改进的、综合的图表向导,有已定义好的简单模板,也可以新建、储存和分享定制模板。
* 对所有数据库项目的多元个性化界面,例如录入区域,实验类型等。
* 数据库共享工具被整合到一般模块中,这使用户或实验员在数据库分享和交换数据更灵活。
* 对每一个数据库在BioNumerics启动窗口都有易于使用的备份和储存选项。
* 重新设计的基于标签的窗口显示每一个功能的插件。
* 改进了在线帮助功能,可以从每个窗口进入。

官方升级信息

2012年1月5日BioNumerics发布6.6版本 (www.shanghaiep.com)

With BioNumerics version 6.6, we are pleased to announce a second minor upgrade in the "6" series. The highlight is the implementation of de novo assembly for next generation sequencing data. The Power Assembler now has become a complete toolset for preprocessing, resequencing and de novo assembly of data from next generation sequencers.

Further great enhancements to the Power Assembler include predefined project templates, offering typical workflows for Roche 454 and Illumina data with single or paired end reads. These workflows allow beginning users to start analysing their data with a low threshold. Modified or user-defined project pipelines can now be saved as analysis templates and can be shared between users.

Furthermore, a number of improvements have been made to the Import plugin, and a number of bugs reported so far in the BioNumerics main program have been resolved.

2010年11月4日BioNumerics发布6.5版本 (www.shanghaiep.com)

  通过升级到Bionumerics 6.5版本,Bionumerics可以用于新一代的生物学数据和分析方法,最大亮点是高效的拼接功能,这是一个强有力的新一代测序数据处理和组装工具。它提供了最大的灵活性,允许任何特殊需求的自动化处理。

  此外,早在Bionumerics 6.0版本就已经引入染色体分析工具,它有效拓展了自动注释功能。现在,Bionumerics 6.5版本已经能够提供染色体为基础的完整分析,其中包含了从新一代测序数据的获取、组装到数据的比对和分析。所有这些工具都是以染色体研究项目为基础,例如:配对、多重排列、注释、SNP分析及聚类分析等。

  另一个亮点就是更加强有力的图表和统计数据处理,呈现给用户友好灵活的交互界面,使用一些最基础的图表来回答复杂的问题,获得很好的统计数据。

2010年4月27日BioNumerics 发布6.1版本 (www.shanghaiep.com)

  升级到6.0版本发布10个月后,我们高兴的告诉大家6.1版本正式发布。它一如既往带有老版本的优良传统,使用一些很小的升级插件就可以获得很有价值的新特征和功能。这次升级中,我们提供了大量的新功能。有效覆盖了数据库、分析和界面等多个方面。

  通过将Kodon功能并入Bionumerics中,我们发布了染色体比对功能模块,它的主要特征就是kodon的染色体为基础的图谱定位,它提供了基因组和染色体的比较、基因组的组织结构和功能行为分析、多染色体排列以及SNP分析和dNdS分析。

  与此同时,6.1版本提供4个新的插件:
   MIRU-VNTR插件:以成功的MLVA插件为基础,MIRU-VNTR插件以结核分枝杆菌散在分布重复单位为分型基础,可自动进行结核杆菌的分型和新的基因型分配。
   SNP genotyping插件:自动的进行以Tagman探针为基础的分型。
   Diversilab插件:输入和分析来源于梅里埃公司的Diversilab系统的数据,自动得到指纹图谱数据库,通过比较得到分型结果。
   User management 插件:有效输入和输出客户信息,对多用户情形下非常有用。

BioNumerics 发布6.0版本 (www.shanghaiep.com)

  通过加入新的软件模块,6.0版本升级后具有新的特征。

  在5.0的基础上,我们又加入了新的功能在软件的交互界面:

   数据库安全和控制工具
   更加全面的聚类分析窗口
   专利技术分析评估运算法则对聚类分析的可靠性
   序列编辑器对测序数据的注释
   直接在比较中进行指纹图谱的编辑
   深入的方差分析和多变量变异数分析

  6.0版本在功能上海拓展了2个新的模块:
   版本和审计追踪
   分子序列分析工具

2008年1月9日BioNumerics发布5.1 (www.shanghaiep.com)

2007年8月10日BioNumerics发布5.0 (www.shanghaiep.com)
 
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