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BioNumerics7 生物信息数据管理与分析一体化平台 / BN分析软件
 

  BioNumerics生物信息数据管理与分析一体化平台是由比利时Applied Maths(应用数学)公司开发。

  BioNumerics是能够以生物学的各种试验数据作为输入数据,以强大的整合数据库为中心,对生物学数据进行比较,分析,研究的系统。它有以下三个重要特征:

  数据管理:提供对指纹图谱、2D胶、基因序列、基因芯片、基因表型特征、矩阵、曲线和动力学描述等所有生物学数据存储,提取,搜索功能,非常适合做生物实验室数据管理的核心。

  数据分析:通过对数据进行比较筛查,分析数据之间的不同点和相似性,从而将数据进行分类,定义,和统计学分析,并可用来鉴定未知的生物体。BioNumerics分析功能的独特之处在于它可以综合多次试验或者不同实验方法的结果,更加全面、快速的分析生物学数据。Shanghai EP

  网络共享:使用BioNumerics提供的网络共享功能,在指定的网络里,用户之间可以方便地交换共享生物数据,并能导入互联网上知名的专业数据库。

  BioNumerics很好的满足了研究机构或诊断机构对不同的生物学数据进行分析的要求。这套软件系统已经得到了很多研究机构,包括疾控中心,大学,医院,公共医疗中心,食品,药物和制药企业等各种实验室的广泛认可。 Shanghai EP

应用模块:

Fingerprint Data 指纹类型数据: Shanghai EP
  对凝胶图谱、自动测序仪数据、lab-on-a-chip系统的电泳指纹图谱等进行标准化处理与分析,如应用于PFGE、MALDI、AFLP、RFLP、RAPD、REP-PCR、ARDRA、IEF、DGGE、TGGE等实验数据分析。
Character Data 特征类型数据: Shanghai EP
  对来源于表型、抗生素耐药谱、微阵列等的特征数据进行导入与分析。在多位点VNTR分析(MLVA)中,该模块提供了自动化的分析流程。
Sequence Data 序列类型数据: Shanghai EP
  对Sanger序列和二代测序数据进行拼接与分析,提供序列分析、搜索和比对以及比较工具。该模块常用于多位点序列分型(MLST)中。
Whole Genome Map Data 全基因组图谱类型数据: Shanghai EP
  对菌株鉴定和分类进行全基因图谱排列和快速可视化聚类。
Trend Data 趋势类型数据: Shanghai EP
  处理实时荧光定量 PCR数据;代谢活性和酶活性的动力学数据;微阵列实验中的时间进程数据等和趋势相关的实验数据。

分析模块: Shanghai EP

Tree and Network Inference 聚类分析与建树: Shanghai EP
  从多种聚类运算方法中选择合适方法计算进化树和关系网。
Dimensioning and Matrix Mining 多维技术与矩阵: Shanghai EP
  使用多种分类技术创建非分层式分组,如成分分析,多向度度量法,判别分析,并找 出群体之间的鉴别特征,字符矩阵进行深入的分析。
Genome Analysis Tools 基因组分析工具 Shanghai EP
  比对和比较染色体或者计算多重染色体排列,计算SNP位点、突变并且注释新的染色 体,进行微生物宏基因组多样性分析。
Classifiers and Identification 分类与鉴定 Shanghai EP
  运用最先进的分类鉴定方法,如Naive Bayesian,SVM,Shrunken Centroids及类似 方法,对未知物种进行分类和鉴定。
Versioning and Audit Trails 版本管理与审计 Shanghai EP
  满足FDA 21CFR Part11关于电子记录、电子签名的规范要求,用于GxP审计。

商业插件: Shanghai EP

Heteroduplex Analysis Plugin Shanghai EP
BandScoring Plugin Shanghai EP
SNP genotyping PluginShanghai EP
Diversilab Plugin:
  与BioMerieux(梅里埃)公司DiversiLab基因分型系统进行数据共享并进一步分析
 
更多的信息请登录BioNumerics中文专门网站:www.bionumerics.cn

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